A forma mais eficiente de colocar Bio Pellets em um aquário é por meio de um filtro de leito fluidizado, pois mantém o grânulo em contato com a água, ao mesmo tempo em que se desprende a antiga colônia de baterias. Recomenda-se que a água de saída do filtro fique próxima à entrada do skimmer, desta forma as bactérias desprendidas serão eliminadas.